1、 试剂配制与贮存区
用于试剂的配制和贮存（包括商业化的试剂），所有试剂的配制与分装。
2、核酸提取区
用于样品的前处理，核酸的提取、纯化与贮存，核酸提取质量检查等。样品前处理所用器皿应经过彻底清洗和高压消毒处理，并单独使用。用过的器皿应采取措施消除核酸的污染，否则不可重复使用。
进行RNA检测的实验室，在此区域内应有专门的RNA操作区。
3、核酸扩增区
用于扩增反应体系的配制和模板的加入，核酸扩增。
4、扩增产物分析区
用于扩增产物的检测和确认。若实验室仅采用全自动扩增检测仪（如实时荧光定量PCR仪），可将核酸扩增区与扩增产物分析区合并为一个区。
适用时，各分隔的工作区域设置缓冲间，缓冲间的压力为负压，与其相连的工作间为正压，工作间与缓冲间之间宜安装磁性连锁装置。未设置缓冲间的工作区域的压力设计一般遵循试剂配制与贮存区为正压，其它三个工作区域为负压或减压的原则。
