1、内分泌因素：扁平苔藓患者女性较多，此病情波动与妊娠、更年期以及内分泌失调有关。
2、遗传因素：据专家研究扁平苔藓的原因和遗传有关系，不少学者研究发现家族中携带的HLA型基因的扁平苔藓患者所，明显高于非家族性扁平苔藓，这说明扁平苔藓发病可能与遗传因素有关。
3、精神神经因素：患者可能因环境、家庭、工作及个人生活等因素，使其受到影响，产生失调紊乱而致病。
4、系统性疾病因素：患有扁平苔藓患者多伴和自身本来的疾病有关，如：肝炎、糖尿病、高血压消化道功能紊乱等。
5、局部刺激因素：不同金属修复体在口内形成电位差或刺激等，使扁平苔藓改变。